Najstaršia písomná zmienka o škole v obci Dlhé Klčovo z roku 1600 sa nachádza v jednom z dokumentov Maďarského národného archívu v Budapešti. Pod vplyvom šírenia myšlienok náboženskej reformácie sa protestantskí kazatelia pôsobiaci v obci (1601 -1706) starali aj o miestnu školu. V roku 1666 sa spomína učiteľ evanjelickej obecnej školy. Jeho meno sa neuvádza.

 História terajšej školy sa uvádza až v  roku 1972, keď v septembri, pri otvorení nového školského roku, bola daná do užívania novopostavená budova základnej päťtriednej školy vybudovanej v rámci štátnej investičnej výstavby. Získaním nových priestorov sa odbúrala dovtedajšia smennosť vyučovania.

Na poste riaditeľa školy sa vystriedali:  OBEŠTER 1972- 1973, Jozef FITZ 1973-1999, od r. 1999 Mgr. J. JANOKOVÁ,od r.2019 Mgr.D.Palenčíková.

V školskom roku 1987/1988 bola pri základnej škole otvorená školská družina pod vedením vychovávateĺky V.Dzurovčinovej. Od toho istého obdobia sa začala zabezpečovať aj pravidelná strava pre žiakov v školskej jedálni zriadenej v kultúrnom dome, čo predstavovalo veľkú výhodu najmä pre zamestnané matky.Vsúčastnej dobe sa školská jedáleň nachádza v priestoroch základnej školy.